Fakultas Farmasi Universitas BTH menyelenggarakan pendidikan berjenjang mulai dari S1 Farmasi, Magister (S2) Farmasi, hingga Program Profesi Apoteker (PSPPA) untuk membentuk tenaga kefarmasian yang kompeten, inovatif, dan berdaya saing global. Program S1 Farmasi berfokus pada penguasaan sains dan teknologi farmasi, pelayanan kefarmasian, riset dasar, serta pembentukan jiwa pharmapreneur. Pada jenjang lanjutannya, S2 Farmasi menawarkan konsentrasi Manajemen Farmasi, Sains Farmasi Klinik, Teknologi Kosmetika, serta Riset dan Pengembangan Teknologi Kesehatan, dirancang untuk membekali mahasiswa dengan kemampuan analisis dan riset tingkat lanjut. Sementara itu, PSPPA mempersiapkan mahasiswa untuk menjalankan praktik kefarmasian profesional melalui pembelajaran sistem blok dan PKPA di rumah sakit, apotek, industri, pemerintah, dan PBF, sebagai bekal untuk memperoleh kompetensi apoteker dan lulus UKAI. Secara keseluruhan, ketiga program ini membentuk lulusan yang siap berkontribusi dalam pelayanan kesehatan, industri, penelitian, dan kewirausahaan farmasi.